Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHADO15335 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHADO15335 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHADO15335 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHADO15335 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHADO15335 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHADO15335 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHADO15335 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHADO15335 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms