Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms