Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPMQ9NSP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms