Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms