Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2BQ9BVA1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms