Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CICQ96RK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CICQ96RK0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CICQ96RK0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CICQ96RK0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CICQ96RK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CICQ96RK0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CICQ96RK0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CICQ96RK0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CICQ96RK0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CICQ96RK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CICQ96RK0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CICQ96RK0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms