Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP6Q96FZ7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms