Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC12Q8WUD4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms