Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1CQ13936 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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