Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB2AQ13885 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2AQ13885 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms