Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01547P58512 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01547P58512 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms