Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB2P29033 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB2P29033 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB2P29033 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB2P29033 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB2P29033 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB2P29033 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB2P29033 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB2P29033 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB2P29033 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB2P29033 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB2P29033 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB2P29033 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB2P29033 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB2P29033 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms