Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB9P28065 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB9P28065 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms