Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPHA1P21709 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms