Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC02184-201ENST00000568121 552 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC011498.1-201ENST00000591414 478 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 GBA-204ENST00000428024 1817 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC016355.1-201ENST00000604760 1533 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC005906.2-210ENST00000640468 1303 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC099489.3-201ENST00000572950 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CHCHD5-201ENST00000324913 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL359692.1-201ENST00000451069 265 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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