Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 39.6
SF3B1O75533 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 39.6
SF3B1O75533 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 39.6
SF3B1O75533 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.055e-6■■■■■ 39.6
SF3B1O75533 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 39.6
SF3B1O75533 SF3B2-208ENST00000529994 1004 ntTSL 212.57□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 39.6
SF3B1O75533 MAN2A2-220ENST00000560192 2469 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 39.5
SF3B1O75533 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 39.5
SF3B1O75533 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 39.5
SF3B1O75533 KDM6A-207ENST00000475233 612 ntTSL 519.84■□□□□ 0.778e-7■■■■■ 39.5
SF3B1O75533 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 224.93■■□□□ 1.589e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 519.87■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 TRMT2A-205ENST00000444256 426 ntTSL 517.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 TRMT2A-215ENST00000487378 654 ntTSL 216.36■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 27.52□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 56.62□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 56.56□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-205ENST00000467086 785 ntTSL 525.63■■□□□ 1.692e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-206ENST00000471535 579 ntTSL 425.62■■□□□ 1.692e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-204ENST00000466567 872 ntTSL 223.01■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 323.01■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-219ENST00000574914 571 ntTSL 423.01■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 523.01■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-222ENST00000576380 943 ntTSL 322.07■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 521.67■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 420.9■□□□□ 0.942e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.942e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NMRAL1-214ENST00000575002 562 ntTSL 417.78■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NMRAL1-216ENST00000575995 413 ntTSL 315.74■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 ERO1B-203ENST00000366589 605 ntTSL 515.68■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 P4HB-220ENST00000575069 2453 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NMRAL1-215ENST00000575557 431 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NMRAL1-218ENST00000576935 279 ntTSL 310.64□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 ARHGAP17-218ENST00000575656 978 ntTSL 310.57□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 HNRNPU-218ENST00000639064 2625 ntTSL 59.63□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-225ENST00000561225 523 ntTSL 58.68□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-222ENST00000560731 432 ntTSL 38.03□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-212ENST00000558223 908 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 TP53BP1-214ENST00000480860 586 ntTSL 36.04□□□□□ -1.442e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-214ENST00000558698 498 ntTSL 45.48□□□□□ -1.532e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-224ENST00000561164 598 ntTSL 44.27□□□□□ -1.732e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-220ENST00000560417 579 ntTSL 34.24□□□□□ -1.732e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MARK3-217ENST00000559268 560 ntTSL 43.75□□□□□ -1.812e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 MAPK1-203ENST00000491588 491 ntTSL 23.64□□□□□ -1.832e-9■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.591e-14■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 27.69□□□□□ -1.181e-14■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.731e-14■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 54.09□□□□□ -1.751e-14■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NKTR-210ENST00000466553 716 ntTSL 23.76□□□□□ -1.811e-14■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.49□□□□□ -2.011e-14■■■■■ 39.4
SF3B1O75533 ZEB2-235ENST00000636445 2947 ntTSL 511.12□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 ZEB2-229ENST00000629520 2564 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 DNM2-222ENST00000593220 561 ntTSL 315.57■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 MEMO1-206ENST00000422936 327 ntTSL 52.09□□□□□ -2.084e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.99□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 CDC42BPA-207ENST00000441725 2183 ntTSL 53.62□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 ZNF692-229ENST00000534456 587 ntTSL 421.11■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 39.3
SF3B1O75533 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.25e-9■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.255e-9■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 CPEB4-210ENST00000522344 481 ntTSL 22.22□□□□□ -2.055e-9■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-220ENST00000476394 601 ntTSL 310.74□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-212ENST00000453352 581 ntTSL 39.52□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-216ENST00000465308 1071 ntTSL 59□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-210ENST00000440875 1809 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-211ENST00000444559 577 ntTSL 48.55□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-240ENST00000637267 2677 ntTSL 57.65□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ZEB2-218ENST00000472146 3837 ntTSL 1 (best)4.14□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TEC-205ENST00000515146 681 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 SEC24C-207ENST00000635550 3424 ntTSL 27.53□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 216.56■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-215ENST00000438141 1743 ntTSL 213.56□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 512.99□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 211.32□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 39.2
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