Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 RPL32-208ENST00000457131 555 ntTSL 26.91□□□□□ -1.33e-6■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 XPO6-209ENST00000566073 715 ntTSL 525.77■■□□□ 1.722e-8■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 LIMD1-AS1-202ENST00000429798 955 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.441e-15■■□□□ 13.2
AATFQ9NY61 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-12■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.824e-12■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.94e-12■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)21■□□□□ 0.957e-46■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 34.23□□□□□ -1.737e-46■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.757e-46■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.167e-46■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 PSPC1-204ENST00000492741 1709 ntTSL 226.4■■□□□ 1.829e-9■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 PSPC1-203ENST00000471658 1647 ntTSL 1 (best)23.08■■□□□ 1.299e-9■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.169e-9■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.029e-9■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 PSPC1-208ENST00000635562 422 ntTSL 33.11□□□□□ -1.919e-9■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-209ENST00000491523 698 ntTSL 327.45■■□□□ 1.981e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-208ENST00000487034 615 ntTSL 1 (best)27.28■■□□□ 1.961e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-212ENST00000563749 2367 nt25.25■■□□□ 1.631e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.621e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-205ENST00000467736 528 ntTSL 320.48■□□□□ 0.871e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-207ENST00000484610 924 ntTSL 518.27■□□□□ 0.521e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-211ENST00000563270 554 ntTSL 418.2■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-213ENST00000565571 568 ntTSL 217.48■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-208ENST00000477613 796 ntTSL 521.36■■□□□ 1.011e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-206ENST00000476268 1623 ntTSL 321.3■■□□□ 11e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-209ENST00000479992 850 ntTSL 319.41■□□□□ 0.71e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-204ENST00000472481 728 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-202ENST00000467825 660 ntTSL 518.42■□□□□ 0.541e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-214ENST00000624069 1122 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.491e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.281e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-210ENST00000484279 794 ntTSL 516.83■□□□□ 0.281e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 RPL13A-212ENST00000488946 2312 ntTSL 216.36■□□□□ 0.211e-37■■□□□ 13.1
AATFQ9NY61 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 236.95■■■■□ 3.516e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-216ENST00000458354 498 ntTSL 335.25■■■■□ 3.236e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 233.5■■■□□ 2.956e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.646e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 331.33■■■□□ 2.616e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.436e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-227ENST00000475172 877 ntTSL 529.92■■■□□ 2.386e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.196e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.056e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CERS2-207ENST00000457392 545 ntTSL 327.16■■□□□ 1.946e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-225ENST00000473680 1232 ntTSL 226.6■■□□□ 1.856e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 425.83■■□□□ 1.736e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 224.61■■□□□ 1.536e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-208ENST00000422811 771 ntTSL 324.25■■□□□ 1.476e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.386e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-220ENST00000465303 868 ntTSL 422.9■■□□□ 1.266e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.236e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-209ENST00000423545 448 ntTSL 422.57■■□□□ 1.26e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-207ENST00000419804 561 ntTSL 422.12■■□□□ 1.136e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-219ENST00000463548 783 ntTSL 522.12■■□□□ 1.136e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 221.95■■□□□ 1.16e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-223ENST00000466662 464 ntTSL 321.9■■□□□ 1.16e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.056e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 321.43■■□□□ 1.026e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-206ENST00000418241 566 ntTSL 321.21■□□□□ 0.996e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-212ENST00000434652 311 ntTSL 521.21■□□□□ 0.996e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-224ENST00000472324 2143 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.856e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.856e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-222ENST00000466638 1204 ntTSL 220.08■□□□□ 0.816e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.756e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.746e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 519.64■□□□□ 0.736e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.616e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 318.01■□□□□ 0.476e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 517.8■□□□□ 0.446e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-232ENST00000489536 836 ntTSL 217.75■□□□□ 0.436e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.436e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 517.74■□□□□ 0.436e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-214ENST00000439087 754 ntTSL 517.69■□□□□ 0.426e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.356e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.356e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.346e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-211ENST00000433470 717 ntTSL 517.08■□□□□ 0.326e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.316e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.276e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.276e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 216.32■□□□□ 0.26e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 BCR-204ENST00000427791 771 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.083e-8■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 414.94□□□□□ -0.026e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.176e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PPIG-211ENST00000530152 690 ntTSL 312.68□□□□□ -0.386e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.46e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 212.45□□□□□ -0.426e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.446e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 212.23□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-212ENST00000480047 575 ntTSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.476e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 211.87□□□□□ -0.516e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 511.8□□□□□ -0.526e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PNCK-205ENST00000411968 557 ntTSL 511.62□□□□□ -0.556e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.616e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.626e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.826e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-213ENST00000483054 592 ntTSL 39.14□□□□□ -0.956e-6■■□□□ 13
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