Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRELD1Q96HD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRELD1Q96HD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms