Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms