Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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