Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3BP58499 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms