Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6GP18545 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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