Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNSO60931 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNSO60931 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNSO60931 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNSO60931 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNSO60931 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNSO60931 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNSO60931 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms