Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 MED18-204ENST00000475655 315 ntTSL 210.22□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 USP30-203ENST00000392784 2483 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 MED18-202ENST00000398997 1106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 MED18-205ENST00000479574 862 ntTSL 29.9□□□□□ -0.824e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.955e-9■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.966e-17■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CEP120-206ENST00000508442 2645 ntTSL 28□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-206ENST00000461417 545 ntTSL 27.85□□□□□ -1.154e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-20■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.244e-14■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 USP30-208ENST00000536393 476 ntTSL 57.17□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.444e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 DMAC1-203ENST00000484082 547 ntTSL 55.64□□□□□ -1.515e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.537e-16■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 STK16-211ENST00000491697 579 ntTSL 25.42□□□□□ -1.544e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.627e-16■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.717e-16■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 CEP120-205ENST00000508138 4720 ntTSL 1 (best)4.03□□□□□ -1.764e-8■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.847e-16■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 NENF-202ENST00000472389 459 ntTSL 315.43■□□□□ 0.064e-22■■■■■ 39.8
DDX3XO00571 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ARMC1-205ENST00000523384 507 ntTSL 321.25■□□□□ 0.991e-10■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ARMC1-204ENST00000519352 686 ntTSL 220.87■□□□□ 0.931e-10■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ARMC1-206ENST00000528721 887 ntTSL 219.1■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ARMC1-203ENST00000518908 1050 ntTSL 317.54■□□□□ 0.41e-10■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-10■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-10■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ATRAID-205ENST00000484646 548 ntTSL 215.39■□□□□ 0.055e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.035e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 SLC35B1-206ENST00000504260 2424 ntTSL 213.56□□□□□ -0.249e-36■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-211ENST00000623632 847 ntTSL 520.82■□□□□ 0.922e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-215ENST00000624503 754 ntTSL 520.82■□□□□ 0.922e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-204ENST00000466863 686 ntTSL 219.53■□□□□ 0.722e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.682e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.369e-9■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-222ENST00000637669 1927 ntTSL 516.46■□□□□ 0.239e-9■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-214ENST00000624474 678 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-218ENST00000636265 1239 ntTSL 513.86□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.319e-9■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-209ENST00000623287 856 ntTSL 512.69□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-205ENST00000477111 826 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-221ENST00000637666 1135 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ADSL-212ENST00000623978 712 ntTSL 56.48□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-9■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 TRMT12-201ENST00000328599 2207 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 TRMT12-202ENST00000521443 562 ntTSL 48.89□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 TRMT12-203ENST00000522518 822 ntTSL 38.19□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 ACP1-212ENST00000484125 559 ntTSL 420.87■□□□□ 0.932e-31■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 NDST2-203ENST00000398701 545 ntTSL 225.17■■□□□ 1.624e-9■■■■■ 39.7
DDX3XO00571 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 39.6
DDX3XO00571 NFE2L1-219ENST00000584137 529 ntTSL 422.81■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 39.6
DDX3XO00571 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.662e-37■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 UBALD2-202ENST00000587913 286 ntTSL 312.57□□□□□ -0.42e-37■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 48.72□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-204ENST00000535423 537 ntTSL 426.5■■□□□ 1.831e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-214ENST00000543803 577 ntTSL 326.5■■□□□ 1.831e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-219ENST00000545600 579 ntTSL 425.59■■□□□ 1.691e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-210ENST00000542019 737 ntTSL 325.59■■□□□ 1.691e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-212ENST00000543088 601 ntTSL 425.55■■□□□ 1.681e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-207ENST00000539399 553 ntTSL 425.55■■□□□ 1.681e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-205ENST00000535819 788 ntTSL 324.92■■□□□ 1.581e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-208ENST00000539741 573 ntTSL 421.4■■□□□ 1.021e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.981e-15■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-218ENST00000471383 969 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-217ENST00000450491 686 ntTSL 313.44□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-214ENST00000440732 592 ntTSL 413.4□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-207ENST00000392263 1630 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.29□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-220ENST00000490682 2911 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 CASP8-201ENST00000264274 2540 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 ZDHHC24-204ENST00000534073 1615 ntTSL 325.55■■□□□ 1.685e-10■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.955e-10■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 ZDHHC24-202ENST00000525925 907 ntTSL 320.54■□□□□ 0.885e-10■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.335e-10■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-25■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-25■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 RHBDD2-209ENST00000476218 181 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-20■■■■■ 39.5
DDX3XO00571 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 MFSD5-205ENST00000552097 427 ntTSL 314.01□□□□□ -0.178e-10■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 ZNF428-202ENST00000595304 569 ntTSL 225.31■■□□□ 1.644e-11■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.444e-11■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 ZNF428-203ENST00000598676 827 ntTSL 519.72■□□□□ 0.754e-11■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-211ENST00000487525 1253 ntTSL 515.14■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-205ENST00000461271 726 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-210ENST00000486827 1609 ntTSL 214.06□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-201ENST00000337432 2591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-207ENST00000475762 2077 ntTSL 212.74□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 39.4
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