Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
U3KQK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
U3KQK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
U3KQK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
U3KQK5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
U3KQK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U3KQK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U3KQK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U3KQK5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U3KQK5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U3KQK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U3KQK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQK5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQK5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQK5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQK5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQK5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQK5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQK5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQK5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQK5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQK5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQK5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
U3KQK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQK5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQK5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQK5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQK5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQK5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQK5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQK5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQK5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQK5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQK5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQK5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms