Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPTNQ9Y639 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPTNQ9Y639 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPTNQ9Y639 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTNQ9Y639 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTNQ9Y639 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPTNQ9Y639 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTNQ9Y639 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms