Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX11Q9Y5W9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX11Q9Y5W9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX11Q9Y5W9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX11Q9Y5W9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX11Q9Y5W9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX11Q9Y5W9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX11Q9Y5W9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX11Q9Y5W9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX11Q9Y5W9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX11Q9Y5W9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX11Q9Y5W9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX11Q9Y5W9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX11Q9Y5W9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX11Q9Y5W9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX11Q9Y5W9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms