Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF2Q9Y5W3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF2Q9Y5W3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLF2Q9Y5W3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLF2Q9Y5W3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF2Q9Y5W3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF2Q9Y5W3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF2Q9Y5W3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF2Q9Y5W3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF2Q9Y5W3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF2Q9Y5W3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms