Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C5Q9Y5Q8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C5Q9Y5Q8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C5Q9Y5Q8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C5Q9Y5Q8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C5Q9Y5Q8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C5Q9Y5Q8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C5Q9Y5Q8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C5Q9Y5Q8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C5Q9Y5Q8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms