Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAI2Q9Y5P3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAI2Q9Y5P3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAI2Q9Y5P3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAI2Q9Y5P3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAI2Q9Y5P3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAI2Q9Y5P3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAI2Q9Y5P3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAI2Q9Y5P3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAI2Q9Y5P3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAI2Q9Y5P3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAI2Q9Y5P3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAI2Q9Y5P3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAI2Q9Y5P3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms