Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN16Q9Y5I7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN16Q9Y5I7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN16Q9Y5I7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN16Q9Y5I7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN16Q9Y5I7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN16Q9Y5I7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN16Q9Y5I7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms