Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NR2E1Q9Y466 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E1Q9Y466 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NR2E1Q9Y466 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NR2E1Q9Y466 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR2E1Q9Y466 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E1Q9Y466 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR2E1Q9Y466 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms