Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y345

SLC6A5, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5Q9Y345 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A5Q9Y345 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A5Q9Y345 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A5Q9Y345 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC6A5Q9Y345 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A5Q9Y345 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A5Q9Y345 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5Q9Y345 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms