Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSX2IPQ9Y2D8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSX2IPQ9Y2D8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSX2IPQ9Y2D8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSX2IPQ9Y2D8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSX2IPQ9Y2D8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms