Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX12Q9UMY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX12Q9UMY4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX12Q9UMY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX12Q9UMY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX12Q9UMY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX12Q9UMY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX12Q9UMY4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX12Q9UMY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX12Q9UMY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SNX12Q9UMY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX12Q9UMY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX12Q9UMY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX12Q9UMY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX12Q9UMY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX12Q9UMY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms