Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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