Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRIP2Q9ULQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP2Q9ULQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRIP2Q9ULQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRIP2Q9ULQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP2Q9ULQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRIP2Q9ULQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRIP2Q9ULQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP2Q9ULQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP2Q9ULQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms