Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TSPAN16Q9UKR8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSPAN16Q9UKR8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSPAN16Q9UKR8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSPAN16Q9UKR8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSPAN16Q9UKR8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN16Q9UKR8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSPAN16Q9UKR8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSPAN16Q9UKR8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN16Q9UKR8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN16Q9UKR8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSPAN16Q9UKR8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSPAN16Q9UKR8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSPAN16Q9UKR8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSPAN16Q9UKR8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSPAN16Q9UKR8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSPAN16Q9UKR8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms