Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
TNIKQ9UKE5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
TNIKQ9UKE5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
TNIKQ9UKE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
TNIKQ9UKE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
TNIKQ9UKE5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
TNIKQ9UKE5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TNIKQ9UKE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TNIKQ9UKE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TNIKQ9UKE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TNIKQ9UKE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
TNIKQ9UKE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
TNIKQ9UKE5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
TNIKQ9UKE5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
TNIKQ9UKE5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TNIKQ9UKE5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
TNIKQ9UKE5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
TNIKQ9UKE5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
TNIKQ9UKE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
TNIKQ9UKE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
TNIKQ9UKE5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
TNIKQ9UKE5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.74
TNIKQ9UKE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
TNIKQ9UKE5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
TNIKQ9UKE5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
TNIKQ9UKE5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
TNIKQ9UKE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TNIKQ9UKE5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TNIKQ9UKE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
TNIKQ9UKE5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
TNIKQ9UKE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.26■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
TNIKQ9UKE5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.2■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
TNIKQ9UKE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
TNIKQ9UKE5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
TNIKQ9UKE5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TNIKQ9UKE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TNIKQ9UKE5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms