Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
AKAP11Q9UKA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
AKAP11Q9UKA4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
AKAP11Q9UKA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
AKAP11Q9UKA4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
AKAP11Q9UKA4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
AKAP11Q9UKA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
AKAP11Q9UKA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AKAP11Q9UKA4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.89■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AKAP11Q9UKA4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AKAP11Q9UKA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AKAP11Q9UKA4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
AKAP11Q9UKA4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
AKAP11Q9UKA4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms