Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FBXO3Q9UK99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FBXO3Q9UK99 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FBXO3Q9UK99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FBXO3Q9UK99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
FBXO3Q9UK99 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FBXO3Q9UK99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FBXO3Q9UK99 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
FBXO3Q9UK99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FBXO3Q9UK99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FBXO3Q9UK99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FBXO3Q9UK99 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FBXO3Q9UK99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FBXO3Q9UK99 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FBXO3Q9UK99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FBXO3Q9UK99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FBXO3Q9UK99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FBXO3Q9UK99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FBXO3Q9UK99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FBXO3Q9UK99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FBXO3Q9UK99 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms