Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MID2Q9UJV3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MID2Q9UJV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MID2Q9UJV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MID2Q9UJV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MID2Q9UJV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MID2Q9UJV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MID2Q9UJV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MID2Q9UJV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MID2Q9UJV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MID2Q9UJV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MID2Q9UJV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms