Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HACL1Q9UJ83 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HACL1Q9UJ83 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HACL1Q9UJ83 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
HACL1Q9UJ83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HACL1Q9UJ83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HACL1Q9UJ83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HACL1Q9UJ83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HACL1Q9UJ83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HACL1Q9UJ83 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HACL1Q9UJ83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HACL1Q9UJ83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HACL1Q9UJ83 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HACL1Q9UJ83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
HACL1Q9UJ83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HACL1Q9UJ83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HACL1Q9UJ83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HACL1Q9UJ83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HACL1Q9UJ83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HACL1Q9UJ83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
HACL1Q9UJ83 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms