Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP25Q9UHP3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP25Q9UHP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP25Q9UHP3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
USP25Q9UHP3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP25Q9UHP3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP25Q9UHP3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
USP25Q9UHP3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP25Q9UHP3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
USP25Q9UHP3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
USP25Q9UHP3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP25Q9UHP3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP25Q9UHP3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP25Q9UHP3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP25Q9UHP3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP25Q9UHP3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP25Q9UHP3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms