Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRODH2Q9UF12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRODH2Q9UF12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRODH2Q9UF12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRODH2Q9UF12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRODH2Q9UF12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRODH2Q9UF12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRODH2Q9UF12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODH2Q9UF12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms