Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF02

CACNG5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG5Q9UF02 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG5Q9UF02 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG5Q9UF02 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG5Q9UF02 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG5Q9UF02 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNG5Q9UF02 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG5Q9UF02 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG5Q9UF02 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG5Q9UF02 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG5Q9UF02 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNG5Q9UF02 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms