Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK5

HCST, Hematopoietic cell signal transducer, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCSTQ9UBK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HCSTQ9UBK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HCSTQ9UBK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HCSTQ9UBK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HCSTQ9UBK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HCSTQ9UBK5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HCSTQ9UBK5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HCSTQ9UBK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HCSTQ9UBK5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HCSTQ9UBK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HCSTQ9UBK5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HCSTQ9UBK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HCSTQ9UBK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HCSTQ9UBK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HCSTQ9UBK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HCSTQ9UBK5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HCSTQ9UBK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HCSTQ9UBK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HCSTQ9UBK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HCSTQ9UBK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HCSTQ9UBK5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HCSTQ9UBK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HCSTQ9UBK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms