Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT3BQ9UBC3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNMT3BQ9UBC3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNMT3BQ9UBC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNMT3BQ9UBC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNMT3BQ9UBC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNMT3BQ9UBC3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNMT3BQ9UBC3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNMT3BQ9UBC3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms