Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SIPA1L2Q9P2F8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SIPA1L2Q9P2F8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SIPA1L2Q9P2F8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SIPA1L2Q9P2F8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SIPA1L2Q9P2F8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SIPA1L2Q9P2F8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SIPA1L2Q9P2F8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SIPA1L2Q9P2F8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SIPA1L2Q9P2F8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SIPA1L2Q9P2F8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SIPA1L2Q9P2F8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SIPA1L2Q9P2F8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SIPA1L2Q9P2F8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SIPA1L2Q9P2F8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SIPA1L2Q9P2F8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SIPA1L2Q9P2F8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SIPA1L2Q9P2F8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SIPA1L2Q9P2F8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SIPA1L2Q9P2F8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SIPA1L2Q9P2F8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SIPA1L2Q9P2F8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SIPA1L2Q9P2F8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SIPA1L2Q9P2F8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
SIPA1L2Q9P2F8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SIPA1L2Q9P2F8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SIPA1L2Q9P2F8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SIPA1L2Q9P2F8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SIPA1L2Q9P2F8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIPA1L2Q9P2F8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SIPA1L2Q9P2F8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SIPA1L2Q9P2F8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SIPA1L2Q9P2F8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
SIPA1L2Q9P2F8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SIPA1L2Q9P2F8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SIPA1L2Q9P2F8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SIPA1L2Q9P2F8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SIPA1L2Q9P2F8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIPA1L2Q9P2F8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
SIPA1L2Q9P2F8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SIPA1L2Q9P2F8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SIPA1L2Q9P2F8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SIPA1L2Q9P2F8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SIPA1L2Q9P2F8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SIPA1L2Q9P2F8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SIPA1L2Q9P2F8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SIPA1L2Q9P2F8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 868.2 ms