Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SACSQ9NZJ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SACSQ9NZJ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SACSQ9NZJ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SACSQ9NZJ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SACSQ9NZJ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SACSQ9NZJ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SACSQ9NZJ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms